Действие разворачивается в Японии. Стране, окруженной морями и океанами. Много лет назад из-за сдвига тектонических плит большая часть материков пошла под дно. И спрос на людей, знающих толк в морском деле, увеличился. «Голубые Русалки» — это организация для молодых девушек, которые хотят служить и посвятить свою жизнь морю. Две юные девочки, Моэке Тина и Акэно Мисаки, мечтали вступить в «Голубые Русалки» и посвятить свою жизнь на флоте.
Поэтому они и обучаются морскому ремеслу в школе. Это история о море, дружбе и о мечте юных героинь. Которым нужно познать тайны моря, обучиться специальным навыкам, что помогут им управлять судном. Смогут ли юные девушки справиться со всеми трудностями и совладать с морем.