Трейн Хартнет – хладнокровный убийца, известный своей четкой работой под прозвищем "Черный кот". Ни одна из его целей не осталась в живых. Трейн действует под тринадцатым номером, на теле присутствует "ХIII", в организации "Хронос". Характер работы отложил на его личность большой отпечаток: Трейн замкнут, жесток и совершенно отчужден от социума. Один "свипер", как называют охотников за головами, меняет уклад его жизни.
Сая Минацуки, юная охотница, вызывает интерес Хартнета. Она привлекает его своими убеждениями, и он меняет своё мнение о жизни. Теперь он намерен покончить со своей деятельностью и оставить её в прошлом. Новая работа сближает его с другими охотниками Евой и Свеном. Трейна ждут новые испытания...