Мир людей связан с глобальной сетью, где обитают загадочные создания под названием дигимоны. Мальчик – Тайчи Ягами уже собирал вещи в детский лагерь, когда узнал о сильной атаке на все системы Токио. Люди остались без выхода в интернет, а поезда стали неуправляемы. Поняв, что его мать с сестрой находятся в опасности, он решает объединиться с другом – Коширо Идзуми, чтобы спасти семью.
Пробравшись в метро, парнишка перемещается в фантастический мир, где знакомится с непонятным созданием, представившимся Агумоном. Существо похоже на средних размеров жёлтого динозавра. Герою удаётся связаться с другом из внешнего мира с помощью специального устройства. Идзуми сообщает ему, что он попал в интернет, в мир дигимонов. Далеко не все эти создания дружелюбно настроены к человечеству. У парня возникает чувство, что именно дигимоны стоят за кибератаками в Японии.