Существование человечество стало под вопросом в 2001 году. Именно тогда на Землю совершили нападение первое нападение некие Ангелы. Второе нападение выпадает на 2015 год и так это оставлять нельзя. Единственное, что помогает людям в выживании – боевые роботы под названием «Евангелионы». Именно они давали отпор Ангелам. Казалось бы, что спасение близко, но не все так просто.
Количество людей, которые могли пилотировать Евангелионами крайне ограниченно. Для этого организация НЕРВ, которая и создала боевых роботов, занимается подготовкой профессиональных пилотов для своих устройств. Одним из них становится новоизбранный Икари Синдзи, которому предстоит преодолеть немало трудностей, чтобы стать пилотом.