Это история о том, как маленький Китаро родился из последнего зуба своего отца, который был последним выжившим из клана ёкаев. Китаро вырос в лесу под присмотром своего отца-духа и своего друга-глаза Медамы Оюдзи. Однажды он узнал, что в мире существует тайна, связанная с его рождением и происхождением ёкаев. Чтобы раскрыть эту тайну, ему пришлось отправиться в путешествие по разным странам и временам, где он встретил множество друзей и врагов, а также узнал о своей судьбе и роли в спасении мира от злого Щелкунчика, который желает уничтожить все сущее.