Аниме рассказывает про мир после экологической катастрофы, достигшей своего пика в 21 веке. Правительства многих стран объединились и теперь города вынуждены собирать налог на углекислый газ с целью не допустить полного краха экономики. Они научились контролировать атмосферу. Вскоре образовался и город, расположенный в небе над Токио под названием Атлас.
Здесь и сосредоточена вся политическая элита, а во главе стоит беспощадная Реко. Однако даже она не смогла предугадать, что одна малышка по имени Карин создала спецустройство под названием Медуза. В это время в бывшей столицей образовалась новая группировка. Они мечтают о мире на основе биологических технологий и хотят избавить людей от загрязнения.